Das 92 vagas para a Copa do Brasil, 70 já estão definidas. Os últimos a garantirem vagas foram o Santos, que foi campeão da Série B, e a Ponte Preta que herdou a vaga do peixe por conta do desempenho no Campeonato Paulista. A Bahia contará com Bahia, Vitória e Barcelona de Ilhéus.
O campeonato é organizado com 80 vagas distribuídas para os torneios estaduais. As 12 vagas restantes são destinadas para os times do G-8 do Brasileirão e de copas estaduais. São elas: Taça Fares Lopes (CE), Copa FGF (RS) e Copa Santa Catarina (SC).
Veja as equipes que já garantiram vaga na Copa do Brasil 2025:
Acre: Independência e Humaitá;
Alagoas: CSE, CRB, ASA e CSA;
Amapá: Oratório e Trem;
Amazonas: Amazonas e Manaus;
Bahia: Bahia, Vitória e Barcelona de Ilhéus;
Ceará: Ceará, Maracanã e Fortaleza;
Distrito Federal: Capital-DF e Ceilândia;
Espírito Santo: Rio Branco-ES e Rio Branco VN;
Goiás: Atlético-GO, Vila Nova e Aparecidense;
Maranhão: Sampaio Corrêa e Maranhão;
Mato Grosso: União Rondonópolis, Cuiabá e Operário VG;
Mato Grosso do Sul: Dourados e Operário-MS.
Minas Gerais: Tombense, América-MG, Cruzeiro, Atlético-MG e Athletic Club;
Pará: Paysandu, Remo, Tuna Luso e São Francisco-PA;
Paraíba: Botafogo-PB e Sousa;
Paraná: Athletico-PR, Maringá, Coritiba, Operário-PR e FC Cascavel;
Pernambuco: Sport, Retrô e Náutico;
Piauí: Altos e Parnahyba;
São Paulo: Palmeiras, Santos, Bragantino, Novorizontino, São Paulo, Inter de Limeira, Votuporanguense e Ponte Preta.
Rio de Janeiro: Flamengo, Fluminense, Nova Iguaçu, Vasco, Botafogo, Portuguesa-RJ e Olaria;
Rio Grande do Norte: América-RN e Santa Cruz-RN;
Rio Grande do Sul: Grêmio, Juventude, Internacional e Caxias;
Rondônia: Barcelona-RO e Porto Velho;
Roraima: São Raimundo-RR e GAS;
Santa Catarina: Brusque e Criciúma;
Sergipe: Confiança e Sergipe.
Tocantins: União-TO e Tocantinópolis.